در محصولات آرایشی و بهداشتی موضعی, جستجوی میکروارگانیسم های بیماریزا مانند استافیلوکوکوس اورئوس, سودوموناس آیروژینوزا و کاندیدا آلبیکنس به دلیل ایجاد بیماری های پوستی و چشمی پیشنهاد می شود. جستجوی سایر میکروارگانیسمها مانند اشرشیاکلی نشانگر مشکلات بهداشتی در فرآیند تولید می باشد.
اشریشیا کُلی (نام علمی: Escherichia coli) یا بطور اختصار E.coli، نوعی باسیل گرم منفی از خانواده انتروباکتریاسهاست که بطور شایع در روده جانوران خونگرم وجود دارد. بیشتر سویههای اشریشیا کلی، بیآزار هستند اما برخی از سروتیپها موجب مسمویت غذایی و اسهال میشوند. این سویههای بیآزار، بخشی از فلور عادی روده هستند. آنها در تولید ویتامین K۲ نقش دارند و از استقرار باکتریهای بیماریزا در روده جلوگیری میکنند. این باکتری، ۰/۱٪ فلور روده را به خود اختصاص دادهاست.
E.coli، باسیل گرم منفی، متحرک ،هوازی بیهوازی اختیاری و بدون اسپور است. این باکتری در شرایط بیهوازی، مخلوطی از اسیدها مانند لاکتات، سوکسینات، اتانول، استات و دی اکسید کربن را تولید میکند. رشد بهینه باکتری در دمای ۳۷ درجه سانتیگراد است اما تا دمای ۴۹ درجه را نیز تحمل کرده و به رشد خود ادامه میدهند. E.coli، هم در شرایط هوازی و هم بیهوازی میتواند رشد کند. سویهها داری تاژک هستند و به خاطر همین، متحرک هستند. تاژک ها متعدد و از نوع پیرامونی می باشند. E.coli و باکتریهای مشابه آن، با استفاده از مکانیسمهایی مانند ترانسفورماسیون، کانژوگاسیون و ترانسداکسیون، ماده ژنتیکی خود را از راه انتقال افقی ژنها به سایر باکتریهای مشابه خود منتقل میکنند.
اشریشیا کلی بر روی محیط آگار مک کانکی(MacConkey )، کلنیهای ارغوانی ایجاد میکند زیرا باکتری از نوع لاکتوز مثبت است و قند را تخمیر کرده و اسید تولید میکند. اسید موجب کاهش pH در محیط آگار مک کانکی شده و در نتیجه رنگ ارغوانی ایجاد میشود. همین اتفاق نیز در محیط ای ام بی (Eosin Methylene Blue) رخ داده و کلنیهای ارغوانی تیره با جلای سبز فلزی ایجاد میکند. باکتری در محیط TSI به صورت اسید/اسید و با تولید گاز و H2S منفی است. از نظر تست IMViC به صورت اندول مثبت، MR مثبت، VP منفی و سیترات منفی است. برای بررسی وجود توکسین میتوان از کشت سلولی یا PCR (واکنش زنجیرهای پلیمراز) استفاده کرد.